Im Laufe der Zeit wurden dem Badischen Landesmuseum weitere Museen in Baden-Württemberg angegliedert. Aktuell sind es in Karlsruhe das Museum beim Markt und das Museum in der Majolika. In Bruchsal unterhält das Badische Landesmuseum das Deutsche Musikautomaten-Museum. Hinzu kommt das Keramikmuseum Staufen. Das Landesmuseum betreibt außerdem das Klostermuseum Hirsau, das Schloss Neuenbürg und das Klostermuseum Salem.